本文標(biāo)題："地質(zhì)微生物是如何成長的？地質(zhì)微生物的代謝機制"
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地質(zhì)微生物是如何活動的？揭開地質(zhì)微生物的代謝機制
分子生物學(xué)幫助調(diào)查者確定給定環(huán)境中存在的微生物和它們在環(huán)境
中(潛在的)的代謝活動，使該方法在地質(zhì)微生物中找到了更廣泛的應(yīng)用
?；旧掀渲性S多技術(shù)是推斷細(xì)胞中特殊分子的生物作用(例如，rDNA
是一個很好的多態(tài)標(biāo)記，因為它是生物重要的，高度保守且進化慢的組
成部分；確定環(huán)境中特異代謝基因的表達預(yù)先推測我們需要尋找的基因
，并且它們的基因產(chǎn)物是什么)。怎樣闡明這些基因，并確定它們的細(xì)
胞功能？這是經(jīng)典基因?qū)W，生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域已經(jīng)發(fā)展多年的
研究模式，并在從大腸桿菌到酵母再到果實和鼠的各種模式系統(tǒng)中應(yīng)用
了幾十年。
因為很多地質(zhì)微生物在實驗室中難以培養(yǎng)(雖然這可能簡單反映了
缺少嘗試而不是一個內(nèi)在問題)，所以現(xiàn)在對它們催化地質(zhì)生物的重要
進程了解較少。但是這將很快得到改變，過去20年里，地質(zhì)微生物在基
因，生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)上都進行了更多的研究。由于培養(yǎng)技術(shù)的發(fā)
展，微生物基因組序列化的費用驟降。進入這個領(lǐng)域的學(xué)生們可以通過
功能基因，生物化學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)手段對感興趣的地質(zhì)微生物原始機制
進行研究。它允許我們提出各種有趣的問題，包括所研究的過程需要什
么基因？這些基因的產(chǎn)物是什么？它們在細(xì)胞中的位置？如何作用(例
如，需要什么分子伴侶一復(fù)合因子，其他蛋白？)？如果它們是酶，催
化效率如何？它們在什么情況下表達？最終，一旦它們的功能確定，地
質(zhì)微生物學(xué)家就回到環(huán)境中尋找這些特殊基因／蛋白的存在和表達情況
有許多基因方法能夠用于研究活細(xì)胞。這里，只對應(yīng)用于地質(zhì)微生
物的常規(guī)基因方法進行討論：突變體的構(gòu)建，DNA在外源宿主中的表達
，并用特殊基因標(biāo)記來使其表達可視化或?qū)λ鼈儺a(chǎn)物在細(xì)胞內(nèi)進行定位
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